En un comentario del artículo donde mencionaba algunas características de Cecil, me hacían conocer la existencia de NetDasm, que es una herramienta para modificar ensamblados .NET. Semanas después, supe de la existencia de Reflexil, que a diferencia del anterior, éste es un plugin para Reflector
En la última versión, este plugin permite modificar el código tanto en IL como C#. Pueden descargar los binarios o el código fuente.